《保健食品原料目錄與保健功能目錄管理辦法》的出臺是一項行業積極的鼓勵性政策制度，對進一步推動和促進保健食品產業健康發展具有重要意義，行業企業期待已久。《食品安全法》確立了保健食品實施注冊與備案雙軌制管理，《辦法》的核心即是保健食品原料目錄和功能目錄，它的出臺是對管理政策的完美補充。
《辦法》對行業的影響主要有：
一是明確了保健食品原料目錄和允許聲稱的保健功能目錄的制定和調整、公布的程序和路徑，改變以往政府主導的局面，讓行業企業站在目錄與功能研究的舞臺中央，極大地鼓勵和促進產業的研發與創新。
二是保健食品備案產品不再局限于維生素和礦物質類原料，更多天然植物提取物的原料加入備案目錄，更多產品快速上市，滿足消費者的需求。
三是根據科學研究與進步，動態調整可以聲稱的保健功能，在去除不符功能的同時，允許新的保健功能準入，這是產業發展的內在要求，也是消費者的消費需求。
四是在保健食品不斷收緊嚴管的當下，《辦法》的出臺對行業來說無疑是針強心劑，讓我們感受到了溫暖，堅定了產業發展的信心。
此外，與《辦法》同期發布的《保健食品標注警示用語指南》也很有意義。歷經20多年的發展，中國保健食品從法規完善、質量安全，產品豐富、工廠優化等多方面取得了巨大進步，但行業內夸大虛假宣傳問題引起社會反感，消費者反映強烈。在當下有限的監管資源面對無限的營銷行為的時候，管理部門針對業內的突出問題，采取在保健食品標注警示語的管理措施，確實很有必要。通過警示標識，有利于強化企業主體責任和自律意識，有利于避免產品的夸大和虛假宣傳，有利于促進消費者正確認知保健食品的功能作用，維護消費者的權益。